Jon Fleetwoodi poolt
NIH rahastamise, publikatsioonide ja patentide kronoloogiline loend dokumenteerib enam kui nelja aastakümmet kestnud pidevaid valitsuse investeeringuid Barici koroonaviiruse tööriistade edasiarendamisse.
USA valitsus on enam kui nelja aastakümne jooksul riiklike tervishoiuinstituutide (NIH) – peamiselt riikliku allergia- ja nakkushaiguste instituudi (NIAID) – kaudu rahastanud Ralph Barici koroonaviiruse uuringuid, alates tema varaseimast avaldatud molekulaarbioloogia tööst kuni aastakümneid kestnud üha keerukamate laboritehnoloogiate, eksperimentaalsete süsteemide, mutatsiooniuuringute ja patenteeritud leiutisteni.
Avalik arutelu Barici koroonaviirusealase töö üle algab sageli 2018. aasta DEFUSE-ettepanekuga või tema koostööga COVID-19-le vahetult eelnenud aastatel.
Föderaalse rahastamise andmed räägivad aga palju pikemat lugu.
DEFUSE’i kirjutamise ajaks oli NIH juba enam kui kolm aastakümmet rahastanud Barici koroonaviiruse uuringute järkjärgulist arendamist.
Selles uuringus tuvastatud varaseim avaldatud tõendusmaterjal pärineb aastast 1984, mil Baric oli NIH rahastatud peatüki kaasautor koroonaviiruse RNA sünteesi molekulaarsete mehhanismide kohta, milles tunnistati NIH toetuse AI19244 toetust.
Järgnevatel aastakümnetel toetasid NIH järjestikused toetused koroonaviiruse laboritehnikate, pöördgeneetika platvormide, mutageneesi süsteemide, nakkuslike kloonide, ogavalkude tootmistehnoloogiate, diagnostika, viiruse sisenemismudelite, hiirega kohandatud viiruste, vaktsiinitehnoloogiate ja valitsuse rahastatud patenteeritud leiutiste väljatöötamist.
Isoleeritud katsete rahastamise asemel edendas NIH koroonaviiruse uuringute pidevat arengut, kusjuures iga teadlaste põlvkond tutvustas uusi laborivõimalusi, mis laiendasid teadlaste sõnul koroonaviiruse genoomidega seotud võimalusi.
Barici NIH rahastatud publikatsioonid tutvustasid korduvalt uusi meetodeid ja tehnoloogiaid, samas kui hilisemad patenditaotlused kinnitasid valitsuse toetust paljudele saadud leiutistele.
Kronoloogiliselt dokumenteerivad rahastamine, publikatsioonid ja patendid enamat kui lihtsalt rahastamise ajalugu.
Need dokumenteerivad koroonaviiruse uurimiseks mõeldud üha keerukamate tööriistade järkjärgulist arendamist.
Kui SARS-CoV-2 2019. aastal ilmsiks tuli, näitasid avalikult kättesaadavad dokumendid, et NIH oli enam kui kolme aastakümne jooksul rahastanud paljude COVID-19 ajastul koroonaviiruse uurimiseks saadaolevate eksperimentaalsete meetodite, laboritehnoloogiate ja uurimisplatvormide väljatöötamist.
1984: Rahastamine AI19244
1984. aastal avaldas Baric, kes oli tollal Lõuna-California ülikooli järeldoktor, NIH rahastatud uuringu koroonaviiruste kohta.
Artiklis „Uuringud hiire koronaviiruse RNA sünteesi mehhanismi kohta“ püüdsid Baric ja tema kolleegid selgitada, kuidas koronaviirused väidetavalt oma genoomi replikeerivad ja RNA-d toodavad, ning pakkusid välja uued mehhanistlikud mudelid koronaviiruste transkriptsiooniks ja replikatsiooniks.
Peatükk tunnustas NIH toetuse AI19244 pakutavat tuge, mis näitab valitsuse rahastamist Barici koroonaviiruse uuringutele aastaid enne, kui ta asutas oma iseseisva labori.
1986–2007: Rahastamine AI023946
1986. aastal andis Riiklik Allergia- ja Nakkushaiguste Instituut (NIAID) Ralph Baricule tema esimese iseseisva R01 toetuse AI023946 pealkirjaga „MHV replikatsiooni mehhanismi uurimine“.
Toetus rahastas uuringut, mille eesmärk oli uurida, kuidas hiire hepatiidiviirus (MHV) – koroonaviirus – oma genoomi replikeerib ja geene ekspresseerib, eesmärgiga mõista molekulaarseid mehhanisme, mis kontrollivad koroonaviiruse replikatsiooni.
NIAID pikendas toetust pidevalt vähemalt 2007. aastani, muutes selle Barici pikaajalise valitsuse rahastatava koronaviiruste uurimisprogrammi aluseks.
2001–2004: Rahastusprojekt GM063228
2001. aastal kiitis NIH-i alla kuuluv Riiklik Üldmeditsiiniteaduste Instituut (NIGMS) heaks Põhja-Carolina Ülikooli Ralph Barici R01 toetusprojekti GM063228 pealkirjaga „Pöördgeneetika koroonaviiruse nakkava konstruktsiooniga“.
Toetus kehtis kuni 2004. aasta lõpuni.
Projekt rahastas koroonaviiruste pöördgeneetika meetodite väljatöötamist, kasutades nakkuslikke cDNA konstruktsioone – tehnoloogiat, mis väidetavalt võimaldab teadlastel kloonitud DNA-st rekonstrueerida täielikke koroonaviiruse genoome, sisse viia määratletud geneetilisi modifikatsioone ja saada rekombinantseid viiruseid eksperimentaalseteks uuringuteks.
Toetus toetas otseselt tööd, mis hiljem tunnustati Barici patendiperekonnas “SARS-i koroonaviiruse nakkava cDNA meetodid ja kompositsioonid”.
2004–2008: Rahastamine AI059136
2004. aastal, pärast SARSi puhangut, kiitis NIAID heaks Ralph Barici R01 toetuse AI059136 pealkirjaga „SARSi pöördgeneetika“.
Toetus rahastas SARS-i koroonaviiruse pöördgeneetika süsteemide väljatöötamist ja rakendamist – tehnoloogia, mis väidetavalt võimaldab teadlastel kloonitud DNA-st rekonstrueerida nakkuslikke viiruseid, viia sisse sihipäraseid geneetilisi modifikatsioone ja eksperimentaalselt uurida nende muutuste mõju.
NIAID pikendas toetust igal aastal kuni 2008. aastani, tagades sellega Barici SARSi pöördgeneetika programmi pideva valitsuse rahastamise.
2005–2009: Rahastusprojekt AI059443
2005. aastal rahastas NIAID P01 projekti AI059443 raames SARS-i koroonaviiruse mitmeprojektilist uurimisprogrammi.
Barici juhtimisel edendas programm SARS-i vaktsiinikandidaatide, nakkuslike koroonaviiruse kloonide ja reagentide, loommudelite väljatöötamist ning uuringuid SARS-i genoomi organisatsiooni, patogeneesi ja viiruse replikatsiooni kohta, samal ajal kui koostööd tegevad teadlased jätkasid vaktsiinide ja patogeneesiga seotud projektidega.
Programmi rahastati kuni 2009. aastani, pakkudes seega jätkusuutlikku valitsuse tuge mitmele paralleelsele SARS-i koroonaviiruse uurimissuunale ühe NIAID-i toetuse raames.
2009–2012: Rahastusprojekt 5R01AI075297
2009. aastal kiitis NIAID heaks toetusprojekti R01 AI075297 pealkirjaga „SARS-CoV patogeneesi mehhanismid vananevatel hiirtel“ ja eraldas Ralph Baricule rahastuse mehhanismide uurimiseks, mille abil SARS-i koroonaviirus väidetavalt põhjustab haigusi vananevatel hiiremudelitel.
Projekt keskendus SARS-CoV patogeneesile vananevatel hiirtel – see on eksperimentaalne mudel, mis on loodud raskete vanusega seotud haiguste paremaks jäljendamiseks.
Rahastamine jätkus pidevalt kuni 2012. aasta lõpuni.
2012–2021: Rahastusprojekt U19AI100625
2012. aastal andis NIAID toetuse U19AI100625 mitmeprojektilisele programmile, mille eesmärk on uurida SARS-CoV-nakkuste süsteemset immunogeneetikat laiemas bioloogilise kaitse ja tekkivate patogeenide kontekstis.
Programm ühendas koroonaviiruse infektsioonide, suure läbilaskevõimega molekulaarse profileerimise, bioinformaatika, loommudelite ja hiiregeneetika uuringud, et uurida peremeesorganismi reaktsioone viirusinfektsioonidele.
Toetus kehtis kuni 2021. aastani.
Alates 2017. aastast laiendati koroonaviiruse alavaldkonda „SARS-CoV infektsioonilt“ valdkonnale „Tekkivad koroonaviiruse infektsioonid koostöös“, samal ajal kui üldprogramm jätkas bioloogilise kaitse ja tekkivate patogeenide koordineeritud uuringute toetamist, kasutades süsteemset immunogeneetikat, bioinformaatikat ja geneetiliselt mitmekesiseid hiiremudeleid.
2013–2017: Rahastusprojekt U19AI107810
2013. aastal andis NIAID toetuse U19AI107810, mis on mitmest projektist koosnev uurimisprogramm pealkirjaga “RNA ja DNA viiruste poolt kodeeritud uudsete geenide iseloomustus”.
Programmi osana juhtis Baric oma projekti pealkirjaga “Iseloomustamata geenide roll kõrge patogeensusega inimese koronaviirustega infektsioonides” ning vastutas samaaegselt kogu programmi ja selle administratiivse tuuma juhtimise eest.
Teised projektid keskendusid gripi-, ebola- ja herpesviirustele ning neid toetasid ühised põhivaldkonnad biokeemia, andmehalduse ja reagentide valdkonnas.
Uute pöördgeneetika tehnoloogiate väljatöötamise asemel kasutas see programm neid võimalusi varem iseloomustamata viirusgeenide, sealhulgas kõrge patogeensusega inimese koroonaviiruste infektsioonidega seotud geenide bioloogiliste funktsioonide uurimiseks.
Rahastus kestis 2017. aasta lõpuni.
2013–2022: Rahastusprojekt AI108197
2013. aastal kiitis NIAID heaks R01 toetusprojekti AI108197 pealkirjaga „Koronaviiruste replikatsioonitäpsuse ja patogeneesi määrajad” – koostööprojekt Vanderbilti ülikooli Mark Denisoni ja Barici vahel.
Projekt uuris mehhanisme, mis väidetavalt määravad, kui täpselt koroonaviirused oma genoomi replikeerivad ja kuidas replikatsioonitäpsus mõjutab viiruse patogeneesi.
Toetust jätkati pidevalt kuni 2022. aastani, toetades seega peaaegu kümme aastat uuringuid koroonaviiruse genoomi replikatsiooni, mutatsioonide ja haiguse vahelise seose kohta.
2014–2018: Rahastusprojekt U19AI109761
Mitmest projektist koosnev programm ühendas nakkushaiguste potentsiaalse diagnostika, molekulaardiagnostika, süsteemibioloogia, genoomse identifitseerimise ja peremeesorganismi ja mikroorganismi interaktsioonide uuringud, samas kui Barici projekt keskendus raskete kopsuhaigustega seotud diagnostiliste ja prognostiliste biomarkerite tuvastamisele.
Rahastamine kestis kuni 2018. aastani ja toetas Barici panust laiemasse NIAIDi algatusse, mille eesmärk on töötada välja uusi lähenemisviise raskete viirusnakkuste diagnoosimiseks ja iseloomustamiseks.
2015–2024: Rahastusprojekt AI110700
2015. aastal andis NIAID Ralph Baricile ja Fang Li’le R01 toetusprojekti AI110700 pealkirjaga „MERS-CoV sisenemise mehhanismid, liikidevaheline ülekanne ja patogenees“.
Projekt uuris, kuidas arvatakse, et MERS-i koroonaviirus siseneb peremeesrakkudesse, kandub edasi erinevate liikide vahel ja põhjustab haigusi.
Rahastamine jätkus pidevalt kuni 2024. aasta lõpuni.
Alates 2020. aastast laiendati MERS-CoV nimetust pealkirjaga „Rakku sisenemine, liikidevaheline ülekanne ja uudse koroonaviiruse patogenees…“, kajastades laiemat keskendumist „tekkivatele“ koroonaviirustele, jätkates samal ajal koroonaviiruse sisenemise, peremeesorganismide ringi ja patogeneesi uuringute toetamist.
2017–2021: Rahastusprojekt AI132178
2017. aastal andis NIAID Ralph Baricule ja Timothy Sheahanile R01 toetustaotluse AI132178 pealkirjaga „Lairibaline viirusevastane aine GS-5734 MERS-CoV ja sellega seotud uute koronaviiruste raviks“.
Projekt rahastas uuringut, et hinnata viirusevastase ühendi GS-5734 (hiljem tuntud kui Remdesivir) toimet MERS-i koroonaviiruse ja sellega seotud uute koroonaviiruste vastu, eesmärgiga töötada välja laia toimespektriga viirusevastane ravi.
Toetus kestis kuni 2021. aastani ja seda täiendati kahe täiendava toetusega 2020. aastal.
Hiljem tunnistati rahastus valitsuse toetuseks Barici patendiperekondades “Hiirtele kohandatud SARS-CoV-2 viirused ja nende kasutamise meetodid” ja “SARS-CoV-2 viirused ja nende kasutamise meetodid”.
2019–2023: Rahastamine AI149644
2019. aastal andis NIAID Baricule U01 toetuse AI149644 pealkirjaga „Hingamisteede viiruste vastaste vaktsiinide ja adjuvantide uurimine“.
Projekt rahastas uuringuid hingamisteede viiruste vaktsiinistrateegiate ja adjuvantide väljatöötamise ja hindamise kohta, pakkudes seeläbi valitsuse rahalist vahendeid uuringuteks, mis käsitlevad uute hingamisteede patogeenide suhtes kohaldatavaid vaktsiiniplatvorme.
Rahastamine kestis kuni 2023. aastani ja seda täiendati 2020. aastal seadmete toetusega, mis peegeldab NIAIDi jätkuvat pühendumust Baricsi vaktsiinide väljatöötamise programmile.
Hiljem tunnistati rahastus valitsuse toetuseks patendiperekondades „Hiirtele kohandatud SARS-CoV-2 viirused ja nende kasutusmeetodid“ ja „SARS-CoV-2 viirused ja nende kasutusmeetodid“.
2020–2024: Rahastamisprogramm U54 CA260543
2020. aastal eraldas NIH-i instituut (NCI) toetusprogrammi U54 CA260543, asutades sellega Põhja-Carolina Seroneti tippkeskuse.
Ralph Barici kaasjuhitud mitmeprojektiline programm toetas SARS-CoV-2 immuunsuse uuringuid, sealhulgas immuunsuse ja haiguse seroloogilisi korrelaate, antikehade vastuseid SARS-CoV-2 ja teistele patogeensetele inimese koroonaviirustele, immunoglobuliini proteoomikat, plasmaravi ja COVID-19-ga seotud koekahjustusi ning spetsiaalseid haldus- ja jagatud ressursikeskusi.
Keskuse rahastamine oli tagatud vähemalt kuni 2024. aastani.
Hiljem tunnistati rahastus valitsuse toetuseks Barici patenditaotluses “SARS-CoV-2 spike-valgu S2 alaühikut sihtivad inimese monoklonaalsed antikehad”.
2021–2023: Rahastamine AI158571
2021. aastal rahastas NIAID mitmeprojektilist programmi „Pan-beetakoronaviiruse vaktsiini väljatöötamine ja arendamine“ (P01AI158571).
Programm toetas koordineeritud uuringuid pan-beetakoronaviiruse vaktsiinide, pan-beetakoronaviiruse valguvaktsiinide, nukleosiididega modifitseeritud mRNA-LNP vaktsiiniplatvormide, pan-beetakoronaviiruse immunogeenide arvutipõhise disaini ning spetsiaalsete bioturvalisuse, immuunjärelevalve ja mitte-inimese primaatide alal.
Rahastamine kestis vähemalt 2023. aastani ja toetas integreeritud algatust vaktsiiniplatvormide väljatöötamiseks, mis pakuksid kaitset mitme beetakoroonaviiruse, mitte ainult ühe koroonaviiruse tüve eest.
2022: Rahastamine AI171292
2022. aastal eraldas NIAID rahastuse projektile U19AI171292 ehk „Kiiresti areneva viirusevastaste ravimite väljatöötamise algatus – AViDD keskus“ (READDI-AC), mida juhivad ühiselt Ralph Baric ja Timothy Willson.
Mitmest projektist koosnev programm toetas laia toimespektriga viirusevastaste ravimite uurimis- ja arendustegevust, sealhulgas spetsiifilisi projekte koronaviiruste vastaste viirusevastaste pliiühendite väljatöötamiseks, samuti kombineeritud teste ja laia toimespektriga viirusevastaseid ravimeid, mis on suunatud koroonaviiruste replikaasile ja helikaasile, lisaks meditsiinilise keemia, ensümoloogia ja ravimite väljatöötamise põhivaldkondadele.
Rahastamine kujutas endast Barici pikaajalise, föderaalselt rahastatud koroonaviiruse uurimisprogrammi edasist laiendamist, mille fookus nihkus koroonaviiruse bioloogia mõistmiselt ja eksperimentaalsete süsteemide arendamiselt koroonaviiruste ja teiste tekkivate viiruste vastaste ravimikandidaatide tuvastamisele ja väljatöötamisele.
2022–2026: Rahastusprojekt AI167966
2022. aastal rahastas NIAID mitmeprojektilist programmi „Laiakaitseliste koroonavaktsiinide struktuuripõhine disain“ (P01AI167966).
Programm toetas koordineeritud uuringuid koroonaviiruse vaktsiinide struktuuripõhise disaini, nanoosakeste vaktsiinide disaini, laia humoraalse immuunsuse kohta koroonaviiruste vastu, viiruse evolutsiooni, vaktsiinide prekliinilise testimise ning spetsiifiliste põhivaldkondade kohta valguteaduses, viroloogias ja uuringutes mitte-inimese primaatidega.
Baric juhtis programmi viroloogia põhivaldkonda.
Rahastamine kestis vähemalt 2026. aastani ja toetas integreeritud jõupingutusi vaktsiinide väljatöötamiseks, mis pakuksid laiaulatuslikku kaitset mitme koroonaviiruse, mitte ainult ühe koroonaviiruse tüve vastu.
Koroonaviiruse patentide väljatöötamine föderaalse rahastamise numbritega
2006: nakkava SARS-i koroonaviiruse cDNA / pöördgeneetika
US 2006/0240530 A1 — AI023946; GM063228
2016: Koroonaviiruse diagnostika
US 2016/0238601 A1 — AI085524, AI057157 ja U19AI107810
2017–2018: Koroonaviiruse kimäärsed ogavalgud
US 2017/0096455 A1; USA patent 9 884 895 — U54AI057157
2021–2022: Hiirtega kohanenud ja rep-SARS-CoV-2 viirused
USA patendid 11 225 508 ja 11 492 379 — AI132178; AI142759; AI100625; AI108197; AI089728; AI149644; HHSN2722017000361
2023: Koroonaviiruse ravimid
2025: SARS-CoV-2 vastased monoklonaalsed antikehad
US 2025/0145691 A1 — U54CA260543
Kokkuvõte
Avalikult kättesaadavad dokumendid ei näita ühtegi eraldiseisvat koroonaviiruste rahastamisprogrammi.
Pigem näitavad nad föderaalvalitsuse pidevaid investeeringuid enam kui nelja aastakümne jooksul.
Alates Barici varaseimast NIH rahastatud koroonaviiruse uuringust 1984. aastal on toetusdokumentides näha selget arengut: koroonaviiruse geenijärjestuste väidetava toimimise selgitamisest läbi koroonaviiruse genoomide manipuleerimise ja geneetilise modifitseerimise tehnoloogiate väljatöötamise, hilisemate mutageneesi ja funktsiooni suurendamise katsete läbiviimise ning lõpuks diagnostika, viirusevastaste ravimite ja vaktsiinide väljatöötamise.
Toetused, publikatsioonid ja patendid dokumenteerivad Ralph Barici USA valitsuse rahastatud koroonaviiruse uurimisprojekti pikaajalist arengut.
