|
Mõisted ja näited |
---|---|
LAI/APPEL põhjus | |
Katkine viaal | Selged tõendid purunenud viaali kohta, mis põhjustab käes klaasikilde, mille tulemuseks on LAI |
Hammustada | Selged tõendid loomahammustuse kohta, mille tulemuseks on LAI |
Nõelatorge | Selged tõendid süstlatorkevigastuse kohta, mille tulemuseks on LAI |
Menetlusvead | Bioohutuse või riskimaandamismenetluste tuvastatud või oletatav rikkumine, mille tulemuseks on lai kasutusmäär. Näited hõlmavad isikukaitsevahendite või esmase tõkestusseadme sobimatut valimist või kasutamist; ebapiisav koolitus; ebaõiged tehnikad või protseduurid; ja proovide väärkäitlemine, sealhulgas bakterikultuuride nuusutamine Petri tassis või allaneelamine sobimatu kätepesu tõttu pärast kinda eemaldamist |
Splash | Selged tõendid pritsitud nakkusohtliku materjali kohta limaskestadele, mille tulemuseks on LAI |
Lekkimine | Selged tõendid nakkusohtliku materjali lekke kohta esmases isoleerimisseadmes või sellest väljaspool |
Tundmatu | Tõendid nakkusohtliku materjali olemasolu või käitlemise kohta, mille tulemuseks oli LAI, kuid nakkusallikas ei olnud teada |
Täpsustamata | Puudub uurimine või oletus LAI põhjuse kohta |
VÕTA asukoht | |
Sise | Patogeenide vabanemine väljaspool esmast biosaasteseadet, näiteks bioloogilise ohutuse kappi, kuid muul viisil piiratud vahetu laborikeskkonnaga ja ei riku sekundaarset biosaastebarjääri. |
Välise | Patogeeni vabanemine väliskeskkonda väljaspool sekundaarset biosaastet. Välise APPELSi näideteks võivad olla aerosoolreovee eraldumine tehniliste rikete ja lekkivate või sobimatult pakitud saadetiste tõttu, LIA-ga töötaja, kes levitab tahtmatult haigusi kogukonda, või mis tahes muu väliskeskkonda sattumise vorm. |
Tabel 1
LAI/VÕTA põhjuste ja VÕTA asukoha määratlused
APELSID=juhuslik patogeen pääseb laborist välja. LAI=laboratoorselt omandatud infektsioon. IKV=isikukaitsevahendid.
Analüüs
Analüüsisime kõiki koondtabeleid, kasutades Maci jaoks Stata/BE 18·0. Viisime läbi muutuvate andmete risttabelid, et järjestada põhjuslikud patogeenid, patogeeni RG-d, juhtumite numbrid, geograafilised asukohad ja AELS-i asukohad, et luua kokkuvõtlik teave LAI-de ja APPELide kohta. Lõime kokkuvõtlikud andmearvud, kasutades Microsoft Power BI ja R tarkvara (versioon 4.3.1).
Tulemused
Kokkuvõte ja demograafiline teave
Selles uuringus tuvastas kontrollikoda 164 aruannet, millest 94 aruannet, milles kirjeldati üksikasjalikult 309 kohalikku tegevuskohta, olid kaasamiseks kõlblikud (1. lisa lk 2–5). 94 aruandest 85 (90·4%) pärinesid eelretsenseeritud ajakirjadest ja moodustasid 143 LAI juhtumit, ülejäänud üheksa teadet (9,6%; 166 LAI juhtumit) saadi veebiartiklitest. 94-st LAI aruandest oli enamik pärit Põhja-Ameerikast (n = 43, 45 · 7%), Euroopast (n = 25, 26 · 6%) või Aasiast (n = 14, 14 · 9%), kusjuures enamik aruandeid pärines USAst (n = 39, 41 · 5%). 309-st üksikust LAI juhtumist esines enamik Põhja-Ameerikas (n=243, 78·6%), millele järgnesid Euroopa (n=28, 9·1%) ja Aasia (n=23, 7·4%), kusjuures enamik teateid pärines USAst (Joonis 1). Enamik LAI juhtumeid esines väidetavalt akadeemilistes (n = 118, 38 · 2%), täpsustamata või ebaselgetes kohtades (n = 77, 24 · 9%), uuringutes (n = 61, 19 · 7%), haiglates (n = 29, 9 · 4%), vaktsiinis (n = 22, 7 · 1%) ja veterinaarlaborites (n = 2, 0 · 6%; Joonis 2).
Joonis 1 Laboratoorselt omandatud nakkusjuhtude aruanded, sealhulgas põhjuslikud patogeenid iga geograafilise piirkonna kohta ajavahemikul 2000–2021. Pange tähele, et 1 juhul ei olnud LAI juhtumi geograafilist asukohta märgitud.
Joonis 2 Laboratoorselt omandatud nakkusjuhtumite aruannete kokkuvõtlikud üksikasjad ajavahemikul 2000–2021
LAI patogeenid
Selles ülevaates tuvastasime 309 üksikut LAI juhtumit, mille põhjustasid 51 patogeeni. 309 LAI juhtumist enamiku põhjustasid Salmonella enterica Typhimurium (S Typhimurium; n=154, 49·8%), Salmonella enteritidis (n=21, 6·8%), vaktsiiniviirus (n=13, 4·2%), Brucella spp (n=12, 3·9%) või Brucella melitensis (n=11, 3·6%; Tabel 2). 309-st teatatud LAI juhtumist registreeriti kaheksa surmajuhtumit (2·6% kõigist LAI-dest), mille põhjustasid N meningitidis (n = 3, 37 · 5% kõigist surmajuhtumitest), Yersinia pestis (n = 2, 25%), S Typhimurium (n = 1, 12 · 5%), Ebola viirus (n = 1, 12 · 5%) või veiste spongioosne entsefalopaatia (BSE; n = 1, 12 · 5%; Tabel 2).
N juhud | N surmajuhtumit† | |
---|---|---|
Bakterid | ||
Salmonella Typhimurium | 154 (49·8%) | 1 (12·5%) |
Salmonella enteritidis | 21 (6·8%) | |
Brucella spp∗ | 12 (3·9%) | |
Brucella melitensis | 11 (3·6%) | |
Neisseria meningitidis | 7 (2·3%) | 3 (37·5%) |
Escherichia coli O157:H7 | 6 (1·9%) | |
Francisella tularensis | 4 (1·3%) | |
Brucella suis | 3 (1·0%) | |
Salmonella Typhi | 3 (1·0%) | |
Staphylococcus aureus | 2 (0·7%) | |
Yersinia pestis | 2 (0·7%) | 2 (25·0%) |
Bacillus anthracis | 1 (0·3%) | |
Bacillus cereus | 1 (0·3%) | |
Brucella abortus | 1 (0·3%) | |
Brucella canis | 1 (0·3%) | |
Burkholderia mallei | 1 (0·3%) | |
Campylobacter jejuni | 1 (0·3%) | |
Klebsiella (Enterobacter) aerogeenid | 1 (0·3%) | |
Leptospira spp | 1 (0·3%) | |
Mükobakterite tuberkuloos | 1 (0·3%) | |
Neisseria gonorrhoeae | 1 (0·3%) | |
Orientia tsutsugamushi | 1 (0·3%) | |
Shigella spp | 1 (0·3%) | |
Vibrio cholerae | 1 (0·3%) | |
Vahesumma | 238 (77·0%) | 6 (75·0%) |
Viirus | ||
Vaccinia virus | 13 (4·2%) | |
Zika virus | 5 (1·6%) | |
Dengue virus | 4 (1·3%) | |
SARS-CoV | 4 (1·3%) | |
HIV | 3 (1·0%) | |
Crimean Congo haemorrhagic fever virus | 2 (0·7%) | |
West Nile virus | 2 (0·7%) | |
Buffalo rõugeviirus | 1 (0·3%) | |
Lehmarõugete viirus | 1 (0·3%) | |
Ebola viirus | 1 (0·3%) | 1 (12·5%) |
Gripiviirus | 1 (0·3%) | |
Lümfotsüütilise choriomeningiidi viirus | 1 (0·3%) | |
Mimiviirus | 1 (0·3%) | |
Noroviirus | 1 (0·3%) | |
Polioviirus | 1 (0·3%) | |
Rekombinantne pesukaru viirus | 1 (0·3%) | |
SARS-CoV-2 | 1 (0·3%) | |
Vahesumma | 43 (13·9%) | 1 (12·5%) |
Parasiit | ||
Cryptosporidium spp | 16 (5·2%) | |
Toxoplasma gondii | 3 (1·0%) | |
Echinococcus spp | 1 (0·3%) | |
Leishmania (Viannia) naiffi | 1 (0·3%) | |
Plasmodium vivax | 1 (0·3%) | |
Vahesumma | 22 (7·1%) | 0 |
Seen | ||
Sporothrix schenckii | 2 (0·7%) | |
Arthroderma benhamiae | 1 (0·3%) | |
Koktsidioidid spp | 1 (0·3%) | |
Histoplasma capsulatum var capsulatum | 1 (0·3%) | |
Vahesumma | 5 (1·6%) | 0 |
Prioon | ||
Veiste spongioosne entsefalopaatia | 1 (0·3%) | 1 (12·5%) |
Kokku | 309 (100·0%) | 8 (100%) |
Tabel 2
LAI juhtumite ja surmajuhtumite põhjuslikud patogeenid
LAI=laboratoorselt omandatud infektsioon.
∗
Aruandes ei nimetatud LAI-d põhjustavaid Brucella liike.
†
Tuletatud LAI juhtumi aruandest.
Bakteriaalsed patogeenid olid LAI-de peamine põhjus, moodustades 77·0% kõigist juhtudest (n=238), millele järgnesid viirused (n=43, 13·9%), parasiidid (n=22, 7·1%), seened (n=5, 1·6%) või BSE-d põhjustav prioonaine (n=1, 0·3%; Tabel 2 ja Joonis 2). Enamik LAI patogeene klassifitseeriti RG2 liikmeteks (n = 251, 81 · 2% kõigist üksikutest patogeenidest), millele järgnesid RG3 (n = 39, 12 · 6%), RG2 / 3 (sõltuvalt jurisdiktsioonist; n = 12, 3 · 9%), määramata RG (n = 4, 1 · 3%) või RG4 (n = 3, 1 · 0%; Lisa 1 lk 2–5 ja Joonis 2).
Menetlusvead olid kohalike tegevuskohtade peamine põhjus, moodustades 69,3% juhtudest (Joonis 2), millele järgnesid teadmata põhjused (9,1%), süstlatorkevigastused (7,4%), lekked (7,1%), täpsustamata (4,2%), pritsmed (1,6%), katkised viaalid (1,0%) või loomahammustused (0,3%). Nende põhjuste hulgas olid menetlusvead ka surmaga lõppevate tagajärgede kõige sagedasem põhjus (62,5%), ülejäänud juhtumite põhjuseks olid süstlatorkevigastused (25,0%) ja tundmatud kokkupuuted (12,5%).
Geograafiliselt põhjustasid enamiku USA juhtumitest S Typhimurium (n = 153), S enteritidis (n = 21) või Cryptosporidium spp (n = 16; Joonis 1). Hiinas oli teatatud 11 juhtumist (3·5% kõigist juhtudest), mille põhjustasid Brucella spp (n = 9) või SARS-CoV (n = 2).
Erinevate patogeenirühmade riskihindamised
LAI-sid põhjustanud bakteriaalsetest patogeenidest oli kõige levinum S Typhimurium (n=154/309, 49·8%), millele järgnesid S enteritidis (n=21, 6·8%), Brucella spp (n=12, 3·9%), B melitensis (n=11, 3·6%) ja N meningitidis (n=7, 2·3%; Tabel 2; Lisa 1 lk 2–3).
S Typhimurium LAIs teatatud 154 juhtumist üks lõppes surmaga. Suurim S Typhimurium’i puhang (n = 109) esines mikrobioloogiat õpetavate laborite õpilaste ja kliinilise mikrobioloogia laborite töötajate seas 38 USA osariigis.23
Haigustest teatati ka laste seas, kes elasid koos kellegagi, kes töötas või õppis mikrobioloogia laboris, ja kuigi need juhtumid kvalifitseerusid tehniliselt APPELideks, ei tehtud vahet üliõpilaste või töötajate ja perekondlike juhtumite vahel. S Typhimurium’i nakkustest 150 (97·4%) olid põhjustatud protseduurivigadest ja neljal (2,6%) olid teadmata teed. Kõik 21 S enteritidise juhtumit olid põhjustatud lekkejuhtumitest. Seitsmest N meningitidis LAI-st neli (55·1%) olid põhjustatud menetlusvigadest ja kolmel (42·9%) olid teadmata põhjused, kolm surmajuhtumit olid seotud menetlusvigadega. 28-st Brucella spp LAI juhtumist, mis olid seotud B abortuse, B melitensise, B canis’e või B suis’ga, olid 21 (75·0%) põhjustatud menetlusvigadest ning ülejäänud juhtumite põhjused olid teadmata või määratlemata (n=7, 25·0%; Liide 1 p 2).
Viiruse patogeenide põhjustatud 43 LAI-st olid kõige levinumad vaktsiiniviirus (n = 13/309, 4 · 2% kõigist LAI-dest), Zika viirus (n = 5, 1 · 6%) ning dengue viirus ja SARS-CoV (n = 4, 1 · 3%). 13-st vaktsiiniviiruse LAI-st ei olnud ükski seotud surmajuhtumitega ja kõik olid kas omandatud akadeemilistes uurimislaborites või allikat ei märgitud. Enamikku neist LAI-dest põhjustasid nõeltega pulgad (n = 9/13, 69 · 2%), mis olid saastunud rekombinantsete vaktsiiniviiruse vektoritega16 (Liide 1 p 4).
Parasiitide põhjustatud LAI-dest olid kõige sagedasemad Cryptosporidium spp (n=16/309, 5·2% kõigist LAI-dest) ja Toxoplasma gondii (n=3, 1·0%) nakkused. Seenpatogeenide põhjustatud LAI-de (n=5, 1·6%) osas oli kõige rohkem teatatud juhtumeid Sporothrix schenckii (n=2, 0·5%) (Tabel 2). Ühe LAI põhjustas prioonaine, mis põhjustab BSE-d (n = 1).
VÕTA ja sellega seotud patogeenide kokkuvõte
Aastatel 2000–2021 teatati 16 VÕTA juhtumist (Tabel 3 ja Lisa 2 lk 2–4), mis hõlmasid bakteriaalseid (n = 6, 37 · 5%) ja viiruslikke (n = 10, 62 · 5%) patogeene, sealhulgas Bacillus anthracis (n = 3, 18 · 8%), SARS-CoV (n = 3, 18 · 8%), polioviirus (n = 3, 18 · 8%), Brucella spp (n = 2, 12 · 5%), suu- ja sõrataudi viirus (n = 2, 12·5%), variola viirus (n=1, 6·3%), Burkholderia pseudomallei (n=1, 6·3%) ja gripiviirus H5N1 (n=1, 6·3%; Tabel 3). Üldiselt ei põhjustanud APELS nakkusi, kuigi võimaliku kokkupuute juhtudest teatati töötajate, ümbritseva kogukonna või loomade puhul. Siiski põhjustasid APPELid mõnel juhul haiguspuhanguid, näiteks 10 528 brutselloosinakkust, mis olid seotud Brucella vaktsiini tootmisüksusega Lanzhous, Hiinas.5
Kuupäev | Asukoht | Rajatise | VÕTA kategooria APPELS | Riskipositsioonid (n) | Juhtumid (n∗) | Põhjustada | Viited: | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Bacillus anthracis | Juuni, 2014 | USA Haiguste Tõrje ja Ennetamise Keskus, bioterrorismi kiirreageerimis- ja kõrgtehnoloogiakeskused, GA, USA | Uurimistöö | Sise | Täpsustamata | 0 | Menetlusnormi rikkumine | 24 |
Aprill–mai, 2015 | Dugway tõestusväljak, TÜ, USA | Uurimistöö | Välise | Täpsustamata | 0 | Menetlusnormi rikkumine | 25,26 | |
Mai, 2012 | Animal Health and Veterinary Laboratories Agency, Surrey, Suurbritannia | Uurimistöö | Välise | 2 | 0 | Menetlusnormi rikkumine | 27,28 | |
SARS-CoV | August, 2003 | Singapuri riiklik ülikool ja Singapuri keskkonnatervise instituut, Singapur | Uurimistöö | Välise | 84 | 1 | Menetlusnormi rikkumine | 3,29,30 |
Detsember, 2003 | Taiwan Military Institute of Preventive Medical Research of the National Defence University, Sanxia, Taiwan | Research | External | 74 | 1 | Procedural error | 3,29,31 | |
Aprill, 2004 | Chinese National Institute of Virology, Beijing, China | Research | External | 747 | 11 | Procedural error | 3,29,32 | |
Suu- ja sõrataudi viirus | Juuni, 2004 | Plum Islandi loomahaiguste keskus, NY, USA | Uurimistöö | Sise | Täpsustamata | 6 veist/siga | Täpsustamata | 33 |
August, 2007 | Pirbright, Surrey, Suurbritannia | Uurimistöö | Välise | Täpsustamata | Täpsustamata | Inseneri | 2,34 | |
Brucella spp | 2019. aasta keskpaik | Lanzhou, Hiina | Vaktsiin | Välise | Täpsustamata | 10 528 | Menetlusnormi rikkumine | 5,35,36 |
2018 | USA, asukoht teadmata | Täpsustamata | Välise | Täpsustamata | Täpsustamata | Täpsustamata | 37 | |
Gripiviirus | Jaanuar, 2014 | Kagu-linnukasvatuse uurimislabor, GA, USA | Uurimistöö | Välise | Täpsustamata | 0 | Menetlusnormi rikkumine | 38 |
Variola viirus | Juuli, 2014 | Riiklik Terviseinstituut, MD, USA | Uurimistöö | Sise | Täpsustamata | 0 | Menetlusnormi rikkumine | 39 |
Burkholderia pseudomallei | Jaanuari keskpaik, 2015 | Tulane’i riiklik primaatide uurimiskeskus, LA, USA | Uurimistöö | Sise | Täpsustamata | 2 primaati | Menetlusnormi rikkumine | 40 |
Polioviirus | septembril 2000; November, 2002 – veebruar, 2003 | India | Vaktsiin | Välise | Täpsustamata | 8 või 10 | Täpsustamata | 41,42 |
Septembril 2014 | Belgia | Vaktsiin | Välise | Täpsustamata | Täpsustamata | Täpsustamata | 43 | |
Aprill, 2017 | Holland | Vaktsiin | Välise | 2 | 0 | Täpsustamata | 44 |
Tabel 3
Sisemise ja välise VÕTA-ga seotud patogeenid
APELSID=juhuslik patogeeni põgenemine laborist.
∗
Kui seda ei ole selgesõnaliselt öeldud, viitavad esitatud andmed inimestega seotud juhtumitele.
Enamik APPELidest olid seotud RG3 (n=12, 75·0%) patogeenidega, ülejäänud juhtudel olid põhjustatud RG2 (n=3, 18·8%) ja RG4 (n=1, 6·3%) patogeenidest. Enamik VÕTA-sid olid välised (n=12, 75·0%). Suurem osa VÕTA-dest esines teadus- või ülikoolilaborites (n=11, 68·8%), millele järgnesid vaktsiinitootmisrajatised (n=4, 25·0%); ühe labori eesmärk (n=1, 6·3%) oli täpsustamata. Geograafiliselt esines suurem osa teatatud VÕTA-dest USAs (n=7, 43·8%), järgnesid Ühendkuningriik ja Hiina (n=2, kumbki 12,5%), Belgia, Singapur, India, Holland ja Taiwan (n=1, kumbki 6,3%).
Arutelu
Selle ulatuse läbivaatamise tulemused näitavad, et LAI-sid ja APELSi esineb perioodiliselt ning LAI ja APPELS-i aruannetes kogutud teave võimaldab reguleerivatel asutustel, bioohutuse spetsialistidel ja labori juhtkonnal teha algpõhjuste analüüsi, et teha kindlaks juhtumite alus. Selliste uuringute õppetunnid annavad teavet riskipõhise bioohutuse ja bioturvalisuse lähenemisviisi kohta, toetades konkreetseid eeskirju ja meetodeid, mis on mõeldud patogeenide tõrjeks laboritingimustes, edendades samal ajal töötajate, kogukonna ja keskkonna ohutust.
LAI juhtumeid põhjustavate patogeenide (st S Typhimurium, S enteritidis, vaccinia virus, Brucella spp ja B melitensis) ja LAI aruannete (st kõik Brucella spp, vaccinia viirus, S Typhimurium, N meningitidis, dengue viirus ja F tularensis) koostis ja hierarhia näivad olevat muutunud, kusjuures viimase 50 aasta jooksul on dokumenteeritud RG2 patogeenide domineerimise suurenemine. RG2 patogeenide domineerimine LAIde ja surmajuhtumite peamiste põhjustena on kooskõlas andmetega, mis on registreeritud Kanada laborijuhtumite teatamise Kanada seiresüsteemis (LINC).45–47 Lisaks parun ja Miller48 tegi sarnaseid tähelepanekuid aastatel 2002–2004 esinenud kohalike tegevuskohtade kohta, kus kõige levinumad põhjused olid Shigella, Brucella, Salmonella ja Staphylococcus aureus. RG-sid kasutatakse bioohutuse stenogrammina, et kvantifitseerida erinevate patogeenidega seotud olemuslikku ohtu. Üksikud riigid määravad RG-d sageli nende sisemise ohu ja muude kohalike tegurite, näiteks endeemilisuse alusel. RG2-patogeeni LAI-de suurenemist võivad selgitada mitmed hüpoteesid, sealhulgas: (1) suurenenud RG2-patogeenide ekspositsioon, mis on tingitud suuremast levimusest kliinikutes, haiglates, õppelaborites ja diagnostikalaborites; 2) väiksema riski tajumine RG2 patogeenidega töötamisel; ning 3) teadusuuringute prioriteetide muutmine. Teatatud RG3 ja RG4 patogeenide LAI-de väiksem arv (vähem kui pool RG2 omast) võib olla tingitud rangematest regulatiivsetest nõuetest, mis nõuavad suuremat bioriski infrastruktuuri taset ja suuremaid nõudeid rajatistele RG3 ja RG4 ainete käitlemiseks, mis loomulikult vähendab inimeste arvu, kes võivad nendega kokku puutuda.
Paljud käesolevas ülevaates esitatud kohalikud tegevuskohad tulenesid käitajatega seotud vigadest, millest enamik teatati menetlusvigade või süstlatorkevigastustena. Teatati, et paljud kohalikud tegevuskohad tulenevad teadmata põhjusest. Paljud laborivead, kas LAI või APPELS, võivad olla tingitud inimlikest vigadest, mis võivad tuleneda ebapiisavast väljaõppest, madalast pädevusest, ebapiisavast arusaamisest halbade laboritavade tagajärgedest või nende tegurite kombinatsioonist. Menetlusvigade näited on järgmised: (1) ajalooliste variolaviiruse ampullide avastamine külmhoonetes laborite kolimise ajal Riikliku Terviseinstituudi ülikoolilinnakus Bethesdas, MD, USA juulis 2014;39 milles juhiti tähelepanu puudustele varude haldamisel ja institutsionaalsete teadmiste edasiandmisel ning 2) elusate siberi katku kultuuride saatmisel USA Kaitseministeeriumi laboritest pärast mittetäielikku inaktiveerimist,49 milles rõhutati vajadust järgida laboratoorseid protseduure ja juhtimisprotsesse. Wurtz ja kolleegid14 esitas tõendid, mis näitavad, et enamik kohalikke tegevusalasid oli seotud tehnilise taristu ja seadmete riketega, kusjuures kõige tõenäolisemateks põhjusteks nimetati halbu bioloogilise ohutuse tavasid ja ebapiisavat tähelepanu heade mikrobioloogiliste põhimõtete ja tavade (GMPP) lagunemise tõttu.1 Kanada LINC-süsteemi andmed, mis avaldatakse iga-aastases LAI-de aruandes, näitasid, et protseduuride puudulik järgimine oli sageli laboratoorsete vahejuhtumite põhjuseks.46,47,50
Käesolevas ülevaates dokumenteeritud APPELS toob esile võimalikud eksimused, sealhulgas inimlikud vead (põhjustatud üksikisikute või rühmade poolt), tehnilised probleemid või mõlema kombinatsioonid. APPELSi põhjustasid peamiselt protseduurivead, nagu näitab Hiinas Lanzhous asuv ulatuslik Brucella APELS, mille põhjuseks oli teadete kohaselt aegunud desinfektsioonivahendite kasutamine vaktsiinide valmistamisel.35 Insenertehnilised tõrked olid vähem levinud, näiteks suu- ja sõrataudiga viirusega saastunud reovee väljapääsemine vanadest, kahjustatud drenaažitorudest, mille tulemuseks oli Ühendkuningriigi lähedal asuvate põllumajandusettevõtete saastumine 2007. aastal.34 Leiti RG3 patogeenide domineerimine, mis peegeldab nende suurt edasikanduvust, mida võimendab sooritatud aktiivsus (nt suuremahuline vaktsiinide tootmine), kuigi see võis olla tingitud vabatahtliku teatamisega seotud loomupärasest kallutatusest.
Uuringul on mõned piirangud. Siin esitatud kohalike õigusabisüsteemide ja VÕTA andmete kokkuvõtet tuleks tõlgendada ettevaatusega, kuna vabatahtlikus aruandluses võib esineda erapoolikust. Kokkuvõtlike tulemuste töötlemata uurimine viitab sellele, et LAI-de ja APPELSi esinemissagedus on pärast Sulkini, Haugi ja teiste uuringute läbiviimist vähenenud,10–15 võimalik, et tänu paranenud laboritavadele, arenenud diagnostikatehnoloogiatele ja suurenenud teadlikkusele bioloogilistest ohtudest. Kuid ilma üldiste ametlike aruandlusnõueteta võiksid siin kokku võetud andmed kujutada endast vaid jäämäe tippu.51 Lisaks võivad selles uuringus sisalduvad aruanded olla kallutatud raskemate või suurte tagajärgedega juhtumite poole. Samuti on olemas võimalus, et kohalikest tegevuskohtadest ei teatata piisavalt, kuna nad ei suuda eristada kogukonnas omandatud nakkusi või kohalikke laike, eriti kui kogukonnas esineb kõrge nakatumise tase,52 näiteks SARS-CoV-2 või Mycobacterium tuberculosis’e korral. Teine piirang on LAI-de või APPELSi võimalik vale klassifitseerimine, mis on tingitud raskustest LAI-de ja väliste APPELide eristamisel, arvestades, et LAI-st mõjutatud isikud lahkuvad tavaliselt laborist, levitades potentsiaalselt nakkust kogukonnas, nagu juhtus SARS-CoV-ga3,29,32 ja Brucella vaktsiini nakkused Hiinas.5,35 Teine piirang on ebajärjekindel või vähe üksikasju, mis on seotud LAI-de või APPELide põhjustega, mistõttu on tavapärase nakkustee asemel vaja laia klassifikatsiooni. Sellegipoolest rõhutab süstlatorkevigastuste suur arv ja muud kasutajate vigadega seotud põhjused vajadust keskenduda töötajate koolitamisele ja hea tootmistava edendamisele. Lõpuks täheldasime Brucella LAI aruannete puhul vastuolu põhjusliku patogeeni üksikasjade koguses (st Brucella spp vs B melitensis, B canis või B abortus).
Kohalike tegevusrühmade ja VÕTA põhjuste parem mõistmine ning sobivate ennetusmeetmete ja -meetmete rakendamine (sealhulgas pidev täiustamine ametliku kohapealse tegevusloa ja VÕTA aruandluse ning algpõhjuste analüüsi kaudu) leevendab tulevasi juhtumeid.
Tugeva institutsioonilise juhtimise, laborite kavandamise ja riskipõhiste tavade kaasamine, mis sobivad töötamiseks teadaolevate bioloogiliste ohtudega, eriti nendega, mis teadaolevalt põhjustavad LAI-sid ja APPELeid, leevendab LAI ja APPELSi esinemist; siiski on oluline tunnistada, et inimlikud eksimused on sageli peamine põhjus ja neid tuleks hoolikalt käsitleda.
Positiivse ja läbipaistva bioohutuse kultuuri edendamiseks bioteaduste laborites tuleks kohaldada integreeritud ja jätkusuutlikku bioriski juhtimise lähenemisviisi, sealhulgas rajatiste ja insenerikontrolli, halduskontrolli, tõhusat koolitust ja pädevust ning juhtimistuge. GMPP parimate tavade juhised laboris on üksikasjalikult esitatud WOAH maapealses käsiraamatus;19 WHO LBM4;1 ja siseriiklikult USA poolt,17 Kanada53 ja Belgia. Lisaks on ISO 35001 Biorisk standardi vabastamine21 võivad olla objektiivseks standardiks bioohutuse ja biosaasteriskide juhtimiseks; edukas rakendamine sõltub aga akrediteerimise saavutamiseks tehtavatest olulistest investeeringutest taristusse.
Toetajad
S.D.B., K.H. ja A.M.B. kavandasid uuringu. Andmeid kogusid S.D.B., S.D., M.K. ja K.K.L. S.D.B ja S.D. kontrollisid alusandmeid. S.D.B., S.D. ja K.K.L. analüüsisid andmeid ja tõlgendasid tulemusi. S.D.B., K.K.L. ja S.D. koostasid arvud. D.B. ja S.D. kirjutasid käsikirja esimese mustandi. K.S., J.O’K., S.S.A., I.S., C.M.S., A.A., A.M.B., K.K., K.H., J.P.K., Z.M.M. ja D.R.H. osalesid käsikirja ülevaatamisel ja toimetamisel. K.H. ja S.D.B. omandasid rahastuse. Kõigil autoritel oli täielik juurdepääs kõigile uuringus sisalduvatele andmetele, nad vaatasid teksti põhjalikult läbi ja muutsid seda, kiitsid heaks lõpliku versiooni ja vastutasid lõplikult avaldamiseks esitamise otsuse eest.
Huvide deklaratsioon
Me ei deklareeri konkureerivaid huve.
Tunnustused
Täname Ben Wakefieldi (Royal Institute of International Affairs, Chatham House, Ühendkuningriik) selle projekti haldustoe pakkumise eest ja David Elliotti (UK International Biosecurity Programme, Ühendkuningriik) tema panuse eest sellesse uuringusse ja panuse eest bioohutuse teadusuuringute teekaardi algatusse. Seda uuringut rahastati Maailma Loomatervise Organisatsioonile (WOAH) antud toetusest Global Affairs Canada relvaohu vähendamise programmi raames osana loomahaiguste ohtude leevendamisest jätkusuutliku laboratoorse bioohutuse ja bioturvalisuse projekti kaudu (grandi number BIO-2018-0010 [P006553]). Seda uuringut rahastas ka Wellcome Trust (grandi number 220211). Uuringu rahastajatel ei olnud mingit rolli uuringu kavandamisel, andmete kogumisel, andmete analüüsimisel, andmete tõlgendamisel ega aruande kirjutamisel. Selles artiklis väljendatud seisukohtade eest vastutavad ainult autorid ja nad ei pruugi esindada nende institutsioonide seisukohti, otsuseid või poliitikat, millega nad on seotud. Selle aruande leiud ja järeldused on autorite omad ega pruugi esindada Haiguste Tõrje ja Ennetamise Keskuse ametlikku seisukohta.
Lisamaterjal (2)
Laadi alla kõik
Täiendav liide 1
Täiendav 2. liide
Viited
- WHO Laboratoorse bioohutuse käsiraamat
Maailma Terviseorganisatsioon, Genf, 2020
- Anderson, I. Suu- ja sõrataud 2007: ülevaade ja õppetunnid
Kuupäev: 11. märts 2008
Juurdepääsu kuupäev: 3. märts 2023
- Furmanski, M. Lühike hirmuäratav ajalugu laboritest põgenevatest viirustest. Kui heade kavatsustega uuringud ohtlike patogeenidega võivad inimesi ohtu seada
https://www.slate.com/technology/2014/04/how-dangerous-viruses-could-escape-from-laboratories.html
Kuupäev: 11. aprill 2014
Juurdepääsu kuupäev: 13. juuni 2022
- Meselson, M., ∙ Guillemin, J., ∙ Hugh-Jones, M. jt. Sverdlovski siberi katku puhang 1979. aastal
Lancet. 1994; 266:1202-1208
- Pappas, G. Lanzhou Brucella leke: suurim laboriõnnetus nakkushaiguste ajaloos?
Clin nakatab Dis. 2022; 75:1845-1847
- Kisskalt, K. Laboratoorsed infektsioonid kõhutüüfuse batsillidega
Z Hyg Infektionskrahkh. 1915; 80:145-162
Sulkin, S.E., ∙ Haug, R.M. Laboris kokku lepitud viirusinfektsioonid
N Engl J Med. 1949; 241:205-213
- Sulkin, S.E., ∙ Haug, R.M. Laboratoorselt omandatud nakkuste uuring
Am J Rahvatervise rahvaste tervis. 1951; 41:769-781
- Haug, R.M. Laboratoorselt seotud infektsioonid: 3921 juhtumi kokkuvõte ja analüüs
Terviselabor Sci. 1976; 13:105-114
- Haug, R.M. Laboriga seotud infektsioonid: esinemissagedus, surmajuhtumid, põhjused ja ennetamine
Annu Rev Microbiol. 1979; 33:41-66
- Haug, R.M., ∙ Sulkin, S.E.m ∙ Schulze, M.L. Laboratoorselt omandatud nakkuste jätkuv tähtsus
Am J Rahvatervise rahvaste tervis. 1965; 55:190-199
- Harrington, J.M., ∙ Shannon, H.S. Tuberkuloosi, hepatiidi, brutselloosi ja shigelloosi esinemissagedus Briti meditsiinilabori töötajatel
Br Med J. 1976; 1:759-762
- Sewell, D.L. Laboriga seotud infektsioonid ja bioohutus
Clin Microbiol Rev. 1995; 8:389-405
- Wurtz, N. ∙ Papa, A., ∙ Hukic, M. jt. Laboratoorselt omandatud nakkuste uuring kogu maailmas bioohutuse 3. ja 4. taseme laborites
Eur J Clin Microbiol nakatab Dis. 2016; 35:1247-1258
- Singh, K. Laboratoorselt omandatud infektsioonid
Clin nakatab Dis. 2009; 49:142-147
- Kimman, T.G., ∙ Smit, E., ∙ Klein, M.R. Tõenduspõhine bioohutus: mikrobioloogiliste isoleerimismeetmete põhimõtete ja tõhususe läbivaatamine
Clin Microbiol Rev. 2008; 21:403-425
- USA Haiguste Tõrje ja Ennetamise Keskus. Bioloogiline ohutus mikrobioloogilistes ja biomeditsiinilistes laborites
https://www.cdc.gov/labs/pdf/SF__19_308133-A_BMBL6_00-BOOK-WEB-final-3.pdf
Kuupäev: juuni, 2020
Juurdepääsu kuupäev: 14. august 2023
- Kojima, K., ∙ Booth, C.M., ∙ Summermatter, K. ∙jt. Riskipõhine taaskäivitamine ülemaailmse labori bioohutuse tagamiseks
Lancet. 2018; 360:260-262
- Maailma Loomatervise Organisatsioon. Peatükk 1.1.4. Bioohutus ja bioohutus: standard bioloogiliste riskide juhtimiseks veterinaarlaboratooriumis ja loomapidamisrajatistes
Maismaaloomade diagnostiliste testide ja vaktsiinide käsiraamat
2021
https://www.woah.org/fileadmin/Home/eng/Health_standards/tahm/1.01.04_BIOSAFETY_BIOSECURITY.pdf
Juurdepääsu kuupäev: 26. oktoober 2023
- Ficociello, B., ∙ Giordano, D., ∙ Incoronato, F. ∙jt. WHO laboratoorse bioohutuse käsiraamat: uus lähenemine turvalisusele
Ann Work Expo Tervis. 2023; 67:425-429
- Rahvusvaheline Standardiorganisatsioon. ISO 35001:2019
Bioriskide juhtimine laboritele ja muudele seotud organisatsioonidele
Rahvusvaheline Standardiorganisatsioon, Genf, 2019
- Sarwar, S., ∙ Vijayan, V. Pakistani kogemused riskihindamise koolituse ja kontseptsioonide rakendamisega alates 4 WHO laboratoorse bioohutuse käsiraamatu väljaanne
J Biosaf Biosec. 2021; 3:99-107
- USA Haiguste Tõrje ja Ennetamise Keskus. Inimese Salmonella typhimurium’iinfektsioonid, mis on seotud kokkupuutega kliiniliste ja õpetavate mikrobioloogia laboritega (lõplik ajakohastamine)
https://www.cdc.gov/salmonella/2011/lab-exposure-1-17-2012.html
kuupäeva alusel: Jan 17, 2012
Juurdepääsu kuupäev: 9. detsember 2021
- USA Haiguste Tõrje ja Ennetamise Keskus. Aruanne võimaliku kokkupuute kohta siberi katkuga
https://www.cdc.gov/labs/pdf/Final_Anthrax_Report.pdf
Kuupäev: 11. juuli 2014
Juurdepääsu kuupäev: 4. märts 2023
- Ostrowski, P.A. AR 15-6 Uurimise aruanne. Individuaalne ja institutsionaalne vastutus elujõuliste Bacillus anthracis’e saatmise eest Dugway tõestusplatsilt
https://s3.documentcloud.org/documents/2691592/Dugway-Proving-Ground-Anthrax-Shipment-AR-15-6.pdf
kuupäeva alusel: 2015
Juurdepääsu kuupäev: 3. märts 2023
- Bacillus anthracis Poores’e inaktiveerimisega seotud DoD laboratoorsete protseduuride, protsesside ja protokollide põhjaliku läbivaatamise komitee
Revisjonikomisjoni aruanne: elusate Bacillus anthracis’e spooride tahtmatu saatmine DoD poolt
https://www.dod.defense.gov/Portals/1/features/2015/0615_lab-stats/Review-Committee-Report-Final.pdf
Kuupäev: 13. juuli 2015
Juurdepääsu kuupäev: 3. märts 2023
- Proov, I. Selgus: 100 ohutusrikkumist Ühendkuningriigi laborites, mis tegelevad potentsiaalselt surmavate haigustega
Kuupäev: 4. detsember 2014
Juurdepääsu kuupäev: 3. märts 2023
- Zhang, S. Ühendkuningriigi valitsuslabor saatis kogemata välja elusa siberi katku
https://www.gizmodo.com/a-uk-government-lab-accidentally-mailed-out-live-anthra-1666866287
Kuupäev: 4. detsember 2014
Juurdepääsu kuupäev: 3. märts 2023
- Demaneuf, G. Hea, halb ja kole: ülevaade SARS-i laborist põgeneb
Kuupäev: Nov 16, 2020
Juurdepääsu kuupäev: 3. märts 2023
- Lim, P.L., ∙ Kurup, A., ∙ Gopalakrishna, G. jt. Laboratoorselt omandatud raske äge respiratoorne sündroom
N Engl J Med. 2004; 350:1740-1745
- Orellana, C. Laboratoorselt omandatud SARS tekitab muret bioohutuse pärast
Lancet nakatab Dis. 2004; 04:64
- Parry, J. Ohutusnõuete rikkumine on hiljutise SARSi puhangu tõenäoline põhjus, ütleb WHO
BMJ. 2004; 328:1222
- Ameerika Ühendriikide valitsuse aruandekohustuse amet. Kõrge kontsentratsiooniga bioohutuse laborid: DHSil puuduvad tõendid järeldamaks, et suu- ja sõrataudiuuringuid saab USA mandriosas ohutult teha
https://www.govinfo.gov/content/pkg/GAOREPORTS-GAO-08-821T/html/GAOREPORTS-GAO-08-821T.htm
Kuupäev: 22. mai 2008
Juurdepääsu kuupäev: 2. jaanuar 2023
- Logan, P. Lõpparuanne võimalike bioturvalisuse rikkumiste kohta Pirbrighti alal
http://news.bbc.co.uk/2/shared/bsp/hi/pdfs/07_09_07finalreporthsefandm.pdf
kuupäeva alusel: 2007
Juurdepääsu kuupäev: 26. oktoober 2023
- Reuters. Üle 6,000 inimese Hiina Lanzhou test on brutselloosi suhtes positiivne – riigimeedia
https://www.reuters.com/article/uk-health-brucellosis-china-idUKKBN27L1LY
Kuupäev: Nov 5, 2020
Juurdepääsu kuupäev: 26. oktoober 2023
- Lanzhou linna tervishoiukomisjon. Lanzhou Instituudi Brucella antikehapositiivse juhtumi käsitlemise bülletään
https://www.wjw.lanzhou.gov.cn/art/2020/9/15/art_4531_928158.html
Kuupäeva alusel: 2022
Juurdepääsu kuupäev: 2. märts 2023
Noor, A ∙ Penzenstadler, N. Ameerika salajaste biolaborite sees
https://www.usatoday.com/story/news/2015/05/28/biolabs-pathogens-location-incidents/26587505/
Kuupäev: 28. mai 2015
Juurdepääsu kuupäev: jaanuar 26, 2022
- USA Haiguste Tõrje ja Ennetamise Keskus. Aruanne gripiviiruse H5N1 laboriproovi tahtmatu ristsaastumise ja saatmise kohta
https://www.stacks.cdc.gov/view/cdc/24766
kuupäeva alusel: 15. august 2014
Juurdepääsu kuupäev: 2. märts 2023
- USA Toidu- ja Ravimiamet. Aruanne volinikule: FDA ülevaade 2014. aastal avastatud viaalidest, millel oli silt “Variola” ja muud viaalid, mis avastati FDA poolt hõivatud hoones NIH ülikoolilinnakus
https://www.fda.gov/media/101811/download
Kuupäev: 13. detsember 2016
Juurdepääsu kuupäev: 1. märts 2023
- USA Haiguste Tõrje ja Ennetamise Keskus. Burkholderia pseudomallei vabastamise valitud agendi uurimise lõpetamine Tulane’i riiklikus primaatide uurimiskeskuses
Kuupäev: 13. märts 2015
Juurdepääsu kuupäev: 2. märts 2023
- Bandyopadhyay, A.S., ∙ Singh, H.,∙ Fournier-Caruana, J. jt. Rajatisega seotud polioviiruste vabastamine kogukondadesse – ohud posteradication ajastule
Emerg nakatab dis. 2019; 25:1363-1369
- Deshpande, J.M., ∙ Nadkarni, S.S., ∙ Siddiqui, Z.A. MEF-1 laboratoorse võrdlustüve tuvastamine polioviiruse tüüp 2 poliomüeliitiga lastel Indias aastatel 2002 ja 2003
Indiaanlane J Med Res. 2003; 118:217-223
- Duizer, E ∙ Rutjes, S., ∙ de Roda Husman, A.M. jt. Riskihindamine, riskijuhtimine ja riskipõhine seire pärast polioviiruse juhuslikust keskkonda viimisest Belgias, september–november 2014
Euro Surveill. 2016; 21, 30169
- Duizer, E. ∙ Ruijs, W.L., ∙ van der Weijden, C.P. jt. Reageerimine loodusliku polioviiruse tüüp 2 (WPV2) levikusündmusele pärast juhuslikku kokkupuudet WPV2-ga, Holland, aprill 2017
Euro Surveill. 2017; 22, 30542
- Choucrallah, D., ∙ Sarmiento, L., ∙ Ettles, S. jt. Inimese patogeenide ja toksiinidega laboratoorse kokkupuute seire: Kanada 2018
Can Commun Dis Rep. 2019; 45:244-251
- Pomerleau-Normandin, D., ∙ Heisz, M., ∙ Tanguay, F. Inimese patogeenide ja toksiinidega laboratoorse kokkupuute seire: Kanada 2017
Can Commun Dis Rep. 2018; 44:297-304
- Thompson, E., ∙ El Jaouhari, M., ∙ Eltayeb, N. jt. Inimese patogeenide ja toksiinidega laboratoorse kokkupuute seire, Kanada, 2021
Can Commun Dis Rep. 2022; 48:484-491
- Parun, E.J, ∙ Miller, J.M. Bakteriaalsed ja seeninfektsioonid diagnostikalaborite töötajate seas: riskide hindamine
Diagn microbiol nakatab dis. 2008; 60:241-246
- Barnes, J.E. Elusad siberi katku proovid, mis saadeti ekslikult üheksasse osariiki, Lõuna-Koreasse
https://www.wsj.com/articles/live-anthrax-samples-mistakenly-shipped-to-nine-states-1432759253
Kuupäev: 28. mai 2015
Juurdepääsu kuupäev: 26. oktoober 2023
- Atchessi, N., ∙ Striha, M., ∙ Edjoc, R. jt. Inimese patogeenide ja toksiinidega laboratoorse kokkupuute seire, Kanada 2020
Can Commun Dis Rep. 2021; 47:422-429
- Blacksell, S.D, ∙ Summermatter, K, ∙ Mazuku, Z.M. jt. Investeeringud bioohutusse ja bioohutusse: vajadus riskipõhise lähenemisviisi ja süstemaatilise aruandluse järele laboritest, õnnetustest, et leevendada laboratoorselt saadud nakkusi ja patogeenide väljapääsemist
Lanceti Mikrob. 2023; 4:E854-E855
- Kozlovac, J.P. Vajadus professionaalse ühiskonna propageerimise järele laboratoorselt omandatud haigustest/juhtumitest teatamise ja analüüsimise süsteemi järele
Appl Biosaf. 2012; 17:56-58
- Kanada valitsus. Kanada bioohutuse standardid ja juhised
https://www.canada.ca/en/public-health/services/canadian-biosafety-standards-guidelines.html
Kuupäev: 8. juuni 2023
Juurdepääsu kuupäev: 16. august 2023